Ce logiciel fonctionne comme un 'proxy', c'est à dire que toutes les requêtes envoyées par le navigateur Web aux serveurs des sites Internets que vous fréquentez passent par lui, ce qui lui permet de les filtrer au passage. Il faut donc pour l'installer indiquer à votre navigateur son adresse (localhost) et son port (8080). Pour être certain que tout est bien configuré, il faut s'assurer que lorsque Proxomitron n'est pas lancé, le 'surf' est impossible. Lorsque cette phase de configuration est terminée, il suffit de cocher des cases pour filtrer les pages web en conséquence.